În golful Guanabara, unde se vor desfăşura probele, au fost găsite cantităţi foarte mari de bacterii rezistente la antibiotice, aşa că sportivii trebuie să evite ca apa contaminată să le intre în gura şi ochi.
Rio de Janeiro a promis că va curăţa golful înainte de Jocurile Olimpice, dar nu a reuşit să-şi îndeplinească obiectivul.
Oficial, jumătate din apa menajeră este deversată netratată direct în golful unde vor avea loc competiţii olimpice. Neoficial ar fi vorba de o cantitate de 70-80%.