El este acuzat de abuz în serviciu, după ce ar fi dispus reţinerea şefului BCCO Alba, Traian Berbeceanu, fără a avea suficiente probe care să îi confirme vinovăţia.
Procurorii DNA susţin că Ioan Mureşan i-a fabricat dosarul, după ce Traian Berbeceanu a refuzat să numească în funcţii cheie mai multe persoane agreate de fostul şef DIICOT.
Traian Berbeceanu a stat în arest din 24 octombrie până în 26 noiembrie 2013, sub acuzaţia că a sprijinit o grupare suspectată de evaziune fiscală cu produse petroliere.